第一百一十二章 水平基因转移
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七七四十九个小时之后。
一大清早,卢赫哼着没调的歌来到电脑屏幕跟前,浏览了一下训练日志,轻轻拍了两下显示器的头,宠溺地说了声:
“乖。”
他的小人工智障,在搭载了tpU的平台上,安然地迭代了一万多轮,验证集里的准确率依然在缓缓提高,对此他很是满意。
虽然不知道还要训练多久,但他丝毫不感到无聊,因为他还有其它事情要做。
经过复杂的流程,他来到了熟悉的动物房里,把一个单间鼠笼从置物架上提了下来。
带着普通的薄手套,他安心地把笼子里那只皮毛柔顺、圆滚滚的大老鼠掏出。
这是第198号“鼠爵”。
虽说都是出自同一个变态之手,编号也临近,鼠爵和鼠爷却大不相同。
如果把鼠爷形容为一个健壮有力脾气暴躁的武士,那么鼠爵就像是一个体态憨厚,但风度优雅的绅士。
它从不咬人、从不打架,甚至从不啃笼子。每天吃饱之后,便会瞪着好奇的大眼珠四处张望。偶尔拿着饲料逗它,它也不恼,而是在执行指令之后,才轻轻地衔过,不急不徐地吃下。
卢赫照例捏着一小块饲料,悬在鼠爵的头顶上画了一个圈。鼠爵立刻就领会到了意思,站起身,撅着圆润的肚子,也跟着转了一个。之后,心满意足地接过饲料,细细地啃着。
这时,趁着饲料转移了鼠爵的注意力,他便会拿过针管,快速从它的尾静脉上抽出半毫升的血。
一直以来,他都觉得这套流程没什么必要。他相信,即便没有食物,鼠爵也不会反抗的。
因为它实在是太过聪慧和温顺,温顺到抽完血后会追着人手要抚摸,像一个委屈的孩子。
不过这种让他直呼“阿伟死了”了的场面很快就要彻底结束了,因为这将是他最后一次给鼠爵抽血。
自从拿到鼠爵以来,他们都本能地觉得,这是一只与人非编码区突变密切相关的造模鼠,因为雷拉曾对它格外珍惜。
于是,鼠爵喜提每三天做一次基因测序的待遇。
结果出乎所有人的意料:与正在持续突变的人类基因组不同,鼠爵的基因组格外稳定,半年多来,一个碱基都没变。
很显然,这是雷拉的把戏,想用它来转移大研究人员的注意力。
但他的这种玩法实在过于幼稚,跟能写出《三十六计》的伟大民族耍心眼,实在是不知天高地厚。
研究资源和人力自打一开始就根本没在鼠爵身上放多少,到今天甚至只剩下卢赫一个。
例行公事而已。
要不是它长得好看、性格又好,卢赫也看都不想看它一眼。
测序结果出来后,他照例对着电脑屏幕挠头。
鼠爵的突变位点比鼠爷多了许多,多出的部分还全都是无法解读的。更奇怪的是,突变的片段都格外的长,都在100bp以上,而且上游都跟着一个启动子。
根据鼠爵的骨龄,它是在卢赫和雷拉相遇之前诞生的。在那个时候,雷拉没有可能拥有锌指技术。那么这么长的片段,究竟是怎么编辑的呢?
一直以来,这个问题都另所有人格外费解。因为即便运气够好,也不可能做得到这种程度。这就好比让一个猴子敲键盘,正好敲出了一部《哈姆雷特》。
甚至还不如猴子敲出来的概率大。
几个月以来,那满屏的红红绿绿都快把他看吐了,也没让他看出什么门道来。所有的可能性都排除了,只剩下一个——
水平基因转移。
水平基因转移是相对于亲代到子代的基因垂直传递而言的,指不通过生殖而进行的、能跨越种间隔离、在亲缘关系或远或近的生物有机体间进行的遗传信息转移或遗传物质交流。
这种基因交流通过无性方式发生,使得遗传物质能够打破生殖隔离在物种间传递,甚至实现遗传物质的跨界传播。
水平基因转移最初发现于大肠杆菌与鼠伤寒沙门氏菌之间,随后发现这种现象在原核生物界非常普遍且重要,在许多原核生物中,水平基因转移产生了10%-20%的基因。甚至有观点认为这是原核生物进化的主导力量。
后来,随着研究的深入,发现这种生物也存在于真核生物中。一些植物比如烟草能够从其共生发根农杆菌中获取基因,包括部分功能性基因。种子植物也存在这种现象。
对于植物中水平基因转移发生的原因,一直没有公认的解释。但有一个共识是,这种现象的发生需要基因供体与受体的直接接触。比如附生、寄生和嫁接。
至于与动物相关的,目前只报道过一种:蛭形轮虫。生活在严苛的环境中的它们,依靠膜损伤和dNA损伤来整合来自于藻类和细菌的外源基因。
至今没有与哺乳动物相关的报道。
他的理智和本能要求他放弃这种无厘头的想法,但领导的话盘踞在头脑中:
思维不受束缚的新鲜血液。
既然你这么说,那就别怪我思维跳脱。
于是他赌气般的起身走到了“植物逆境生物学研究中心”门口,正摊在椅子上仰头发呆的竺丘看到卢赫后,立刻起身迎了上来,一脸好奇。
“又有活的了?”竺丘问着,视线直往卢赫的身上、手里、身后扫。
“没有,我是来找你做跨部门协助的。我需要访问最新的植物基因库,给我开个权限吧。”卢赫一板一眼地说。
竺丘收回视线,换回了萎靡而不耐烦的表情,“让你们领导来沟通。”
说完,转身就要走。
卢赫早已习惯对方一如既往的消极态度,没有吃瘪,而是在他身后幽幽的说:
“我就是领导。”
竺丘疑惑地转头,露出不可思议的表情。
“我是人类逆境生物学研究组的pI,现在正式向你们请求协助。”
装了个大比,顺利拿到想要的东西后,他匆匆返回。老远就看到郑K站在他的炼丹炉前连连摇头。
凑过去看发现,验证集准确率已经不再升高,损失也不再下降。
目前的准确率距离可用还远得很,可模型已经不再继续收敛。小人工智障夭折了。
“我都说了,样本太少,你这方法不行。”郑K叹了一口气。
卢赫不以为然,“急什么?我还没调参呢。”
“你运气不是一向不好吗,你能调得出来?”郑K语气认真。
“当然能。”卢赫自信满满,“我还有一张王牌。”
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七七四十九个小时之后。
一大清早,卢赫哼着没调的歌来到电脑屏幕跟前,浏览了一下训练日志,轻轻拍了两下显示器的头,宠溺地说了声:
“乖。”
他的小人工智障,在搭载了tpU的平台上,安然地迭代了一万多轮,验证集里的准确率依然在缓缓提高,对此他很是满意。
虽然不知道还要训练多久,但他丝毫不感到无聊,因为他还有其它事情要做。
经过复杂的流程,他来到了熟悉的动物房里,把一个单间鼠笼从置物架上提了下来。
带着普通的薄手套,他安心地把笼子里那只皮毛柔顺、圆滚滚的大老鼠掏出。
这是第198号“鼠爵”。
虽说都是出自同一个变态之手,编号也临近,鼠爵和鼠爷却大不相同。
如果把鼠爷形容为一个健壮有力脾气暴躁的武士,那么鼠爵就像是一个体态憨厚,但风度优雅的绅士。
它从不咬人、从不打架,甚至从不啃笼子。每天吃饱之后,便会瞪着好奇的大眼珠四处张望。偶尔拿着饲料逗它,它也不恼,而是在执行指令之后,才轻轻地衔过,不急不徐地吃下。
卢赫照例捏着一小块饲料,悬在鼠爵的头顶上画了一个圈。鼠爵立刻就领会到了意思,站起身,撅着圆润的肚子,也跟着转了一个。之后,心满意足地接过饲料,细细地啃着。
这时,趁着饲料转移了鼠爵的注意力,他便会拿过针管,快速从它的尾静脉上抽出半毫升的血。
一直以来,他都觉得这套流程没什么必要。他相信,即便没有食物,鼠爵也不会反抗的。
因为它实在是太过聪慧和温顺,温顺到抽完血后会追着人手要抚摸,像一个委屈的孩子。
不过这种让他直呼“阿伟死了”了的场面很快就要彻底结束了,因为这将是他最后一次给鼠爵抽血。
自从拿到鼠爵以来,他们都本能地觉得,这是一只与人非编码区突变密切相关的造模鼠,因为雷拉曾对它格外珍惜。
于是,鼠爵喜提每三天做一次基因测序的待遇。
结果出乎所有人的意料:与正在持续突变的人类基因组不同,鼠爵的基因组格外稳定,半年多来,一个碱基都没变。
很显然,这是雷拉的把戏,想用它来转移大研究人员的注意力。
但他的这种玩法实在过于幼稚,跟能写出《三十六计》的伟大民族耍心眼,实在是不知天高地厚。
研究资源和人力自打一开始就根本没在鼠爵身上放多少,到今天甚至只剩下卢赫一个。
例行公事而已。
要不是它长得好看、性格又好,卢赫也看都不想看它一眼。
测序结果出来后,他照例对着电脑屏幕挠头。
鼠爵的突变位点比鼠爷多了许多,多出的部分还全都是无法解读的。更奇怪的是,突变的片段都格外的长,都在100bp以上,而且上游都跟着一个启动子。
根据鼠爵的骨龄,它是在卢赫和雷拉相遇之前诞生的。在那个时候,雷拉没有可能拥有锌指技术。那么这么长的片段,究竟是怎么编辑的呢?
一直以来,这个问题都另所有人格外费解。因为即便运气够好,也不可能做得到这种程度。这就好比让一个猴子敲键盘,正好敲出了一部《哈姆雷特》。
甚至还不如猴子敲出来的概率大。
几个月以来,那满屏的红红绿绿都快把他看吐了,也没让他看出什么门道来。所有的可能性都排除了,只剩下一个——
水平基因转移。
水平基因转移是相对于亲代到子代的基因垂直传递而言的,指不通过生殖而进行的、能跨越种间隔离、在亲缘关系或远或近的生物有机体间进行的遗传信息转移或遗传物质交流。
这种基因交流通过无性方式发生,使得遗传物质能够打破生殖隔离在物种间传递,甚至实现遗传物质的跨界传播。
水平基因转移最初发现于大肠杆菌与鼠伤寒沙门氏菌之间,随后发现这种现象在原核生物界非常普遍且重要,在许多原核生物中,水平基因转移产生了10%-20%的基因。甚至有观点认为这是原核生物进化的主导力量。
后来,随着研究的深入,发现这种生物也存在于真核生物中。一些植物比如烟草能够从其共生发根农杆菌中获取基因,包括部分功能性基因。种子植物也存在这种现象。
对于植物中水平基因转移发生的原因,一直没有公认的解释。但有一个共识是,这种现象的发生需要基因供体与受体的直接接触。比如附生、寄生和嫁接。
至于与动物相关的,目前只报道过一种:蛭形轮虫。生活在严苛的环境中的它们,依靠膜损伤和dNA损伤来整合来自于藻类和细菌的外源基因。
至今没有与哺乳动物相关的报道。
他的理智和本能要求他放弃这种无厘头的想法,但领导的话盘踞在头脑中:
思维不受束缚的新鲜血液。
既然你这么说,那就别怪我思维跳脱。
于是他赌气般的起身走到了“植物逆境生物学研究中心”门口,正摊在椅子上仰头发呆的竺丘看到卢赫后,立刻起身迎了上来,一脸好奇。
“又有活的了?”竺丘问着,视线直往卢赫的身上、手里、身后扫。
“没有,我是来找你做跨部门协助的。我需要访问最新的植物基因库,给我开个权限吧。”卢赫一板一眼地说。
竺丘收回视线,换回了萎靡而不耐烦的表情,“让你们领导来沟通。”
说完,转身就要走。
卢赫早已习惯对方一如既往的消极态度,没有吃瘪,而是在他身后幽幽的说:
“我就是领导。”
竺丘疑惑地转头,露出不可思议的表情。
“我是人类逆境生物学研究组的pI,现在正式向你们请求协助。”
装了个大比,顺利拿到想要的东西后,他匆匆返回。老远就看到郑K站在他的炼丹炉前连连摇头。
凑过去看发现,验证集准确率已经不再升高,损失也不再下降。
目前的准确率距离可用还远得很,可模型已经不再继续收敛。小人工智障夭折了。
“我都说了,样本太少,你这方法不行。”郑K叹了一口气。
卢赫不以为然,“急什么?我还没调参呢。”
“你运气不是一向不好吗,你能调得出来?”郑K语气认真。
“当然能。”卢赫自信满满,“我还有一张王牌。”
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